Według nowego badania w oceanach świata zidentyfikowano ponad 5000 nowych typów wirusów.
Badacze przeanalizowali dziesiątki tysięcy próbek wody z całego świata, szukając wirusów RNA lub wirusów, które wykorzystują RNA jako materiał dziedziczny. Na przykład nowy koronawirus jest rodzajem wirusa RNA. Te wirusy są badane w porównaniu z wirusami DNA, które używają DNA Jako materiał genetyczny, powiedzieli autorzy.
Różnorodność nowo odkrytych wirusów była tak duża, że naukowcy zasugerowali podwojenie liczby grup taksonomicznych potrzebnych do klasyfikacji wirusów RNA, z obecnych pięciu do dziesięciu typów. (Era to szeroka klasyfikacja w biologii, która zalicza się do „królestwa”).
„Jest tu wiele nowych odmian – i pełna różnorodność [new] W oceanach występuje gromada Taraviricota, co wskazuje, że jest ważna z ekologicznego punktu widzenia” – powiedział główny autor badania Matthew Sullivan, profesor mikrobiologii na Ohio State University. Powiedział w oświadczeniu (Otwiera się w nowej karcie).
Związane z: Najbardziej śmiercionośny wirus w historii
Według Sullivana badania nad wirusami RNA zazwyczaj skupiały się na tych, które powodują choroby. (Niektóre dobrze znane wirusy RNA obejmują grypę, Ebolę i koronawirusa wywołującego COVID-19.) Ale to tylko „mały kawałek” wirusów RNA na Ziemi, powiedział Sullivan.
„Chcieliśmy badać to systematycznie na bardzo dużą skalę i badać środowisko, któremu nikt nie przyjrzał się dogłębnie” – powiedział Sullivan w oświadczeniu.
Do badania opublikowanego w czwartek (7 kwietnia) w czasopiśmie Nauki ścisłe (Otwiera się w nowej karcie)W ramach badania naukowcy przeanalizowali 35 000 próbek wody pobranych ze 121 miejsc we wszystkich pięciu oceanach świata. Naukowcy są częścią Tara Ocean Consortium, globalnego projektu mającego na celu zbadanie wpływu Zmiana klimatu na oceanie.
Naukowcy powiedzieli, że zbadali sekwencje genetyczne wyekstrahowane z małych organizmów wodnych znanych jako plankton, które są powszechnymi gospodarzami wirusów RNA. Ustalili sekwencje należące do wirusów RNA, szukając starożytnego genu zwanego RdRp, który znajduje się we wszystkich wirusach RNA, ale jest nieobecny w innych wirusach i komórkach. Zidentyfikowali ponad 44 000 sekwencji z tym genem.
Ale gen RdRp ma miliardy lat i ewoluował wiele razy. Ponieważ ewolucja genu sięga wstecz, naukowcom trudno było określić ewolucyjny związek między sekwencjami. Dlatego naukowcy wykorzystali uczenie maszynowe, aby je uporządkować.
W sumie zidentyfikowali około 5500 nowych gatunków wirusów RNA, które należą do pięciu istniejących klas, oprócz pięciu nowo zaproponowanych klas, które naukowcy nazwali Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota i Arctiviricota.
Naukowcy piszą Rozmowa. (Otwiera się w nowej karcie)
Zrozumienie, w jaki sposób gen RdRp zmienia się w czasie, może pomóc w lepszym zrozumieniu, jak rozwija się wczesne życie GruntAutorzy powiedzieli.
„RdRp jest przypuszczalnie jednym z najstarszych genów – był obecny, zanim potrzebne było DNA” – powiedział w oświadczeniu współautor badania, Ahmed Zayed, naukowiec z mikrobiologii stanu Ohio. Śledzimy więc nie tylko pochodzenie wirusów, ale także pochodzenie życia.
Pierwotnie opublikowany w Live Science.
„Amatorski przedsiębiorca. Profesjonalny ekspert od internetu. Człowiek zombie. Nieuleczalny badacz popkultury”.